Laboratorium merupakan salah satu prasarana akademik yang berfungsi sebagai perangkat penunjang dalam usaha pendidikan agar tujuan pendidikan tercapai. Laboratorium Agroteknologi Fakultas Pertanian dapat digunakan untuk kegiatan-kegiatan yang berhubungan dengan mata kuliah dan praktikum, pendalaman materi di Laboratorium dan analisis data penelitian. Adapun Laboratorium Agroteknologi sebagai berikut :

No.	Nama Laboratorium	Kepala Laboratorium	Laboran
1.	Laboratorium Produksi	Nova Triani, SP., MP.	Rahadi Purbantoro, SP.
2.	Laboratorium Bioteknologi	Saefurrohman, SP., M.Sc.	Rahadi Purbantoro, SP.
3.	Laboratorium Dasar Klimatologi & Biologi	Noni Rahmadhini, SP., M.Sc.
4.	Laboratorium Kesehatan Tanaman	Ramadhani Mahendra Kusuma, SP., MP., M.Sc.	Ika Nurfitriana, SP. MP.
5.	Laboratorium Sumber Daya Lahan	Ir. Siswanto, MT.	Wiga Fikri Destianisma, SP.